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大量的研究资料表明，白癜风发病和自身免疫有关，因而认为白癜风是自体免疫性疾病。白癜风的诱发性因素有很多，从现在医学上所掌握的情况来看，这一学说的依据如下：
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1、患者血清中有器官特异性抗体，如抗甲状腺抗体、抗胃壁细胞抗体、抗核抗体、抗平滑肌抗体等。其中以抗甲状腺和抗胃壁细胞抗体为高。
2、病人存在着细胞免疫及体液免疫异常。
3、用免疫抑制剂治疗有效。
4、患者血清中可测到抗黑素细胞抗体，阳性率达50—93%。且与病情的活动程度，白斑面积的大小成正比。这种抗体特异性地作用于黑素细胞，通过补体介导的溶细胞作用和抗体依赖细胞介导的细胞毒作用，直接损伤黑素细胞。
5、白癜风常伴有其它自体免疫性疾病，其发生率较普遍人群高5—15倍。这些疾病包括：甲状腺疾病(甲状腺功能亢进症、甲状腺机能减退症、甲状腺炎)、糖尿病、恶性贫血、类风湿性关节炎、银屑病、斑秃、晕痣、异位性皮炎等。其中以甲状腺疾病与白癜风的伴发率高，约为7.5%。
可以看出，白癜风的发病与免疫系统异常有关，黑色细胞的破坏，很可能是自体免疫反应的结果，但是这些都是种种推断，目前两者确切的联系性还尚未清楚，需要近一步的研究。